Journal of Crop Production and Processing
نشریه تولید و فرآوری محصولات زراعی و باغی
Isfahan University of Technology - Journal of Crop Production and Processing
http://jcpp.iut.ac.ir
1
admin
2251-8517
2251-8525
fa
jalali
1388
1
1
gregorian
2009
4
1
13
47
online
1
fulltext
fa
پراکنش گونههای سینوریزوبیومی Sinorhizobium meliloti و S. medicae همزیست با یونجه در مناطق غربی ایران
Distribution of Alfalfa Nodulating Sinorhizobium meliloti and S. medicae in Western Regions of Iran
عمومى
General
پژوهشي
Research
به منظور تعیین پراکنش جغرافیایی سینوریزوبیومهای همزیست با یونجه در نواحی غرب و شمال غرب ایران، تعداد 950 جدایه از سینوریزوبیومهای همزیست با دو جمعیت یونجه داخلی (همدانی و نیک شهری) و یک جمعیت خارجی (کودی) در هشت خاک جمعآوری شده از استانهای کردستان، کرمانشاه، آذربایجان شرقی و کردستان انتخاب شدند. شناسایی دقیق این جدایهها به همراه 14 جدایه تولید کننده گره در یونجه زرد (Melilotus officinalis) و 31 جدایه همزیست با شنبلیله (Trigonella foenum-graecum) در منطقه اصفهان، براساس روشهای ملکولی صورت گرفت. با تکثیر قسمتی از نواحی ژنهای nod و mucR در این جدایهها با استفاده از آغازگرهای توصیه شده، توالی یابی نوکلئوتیدی نواحی مزبور و هضم آنزیمی قطعه تکثیری قسمتی از ناحیه ژنی 16S rRNA با استفاده از آنزیم برشی RsaI، سه جدایه از یونجه، هفت جدایه از یونجه زرد و 13 جدایه از شنبلیله به عنوان باکتری S. medicae تشخیص داده شدند و بقیه جدایهها (943 از یونجه، هفت جدایه از یونجه زرد و 18 جدایه از شنبلیله) متعلق به گونه S. meliloti بودند. گرچه هر دو گونه سینوریزوبیومی از تمام گیاهان میزبان جداسازی شدند، ولی غالب بودن S. meliloti در مناطق مختلف روی جمعیتهای یونجه مشخص نمود کهS. meliloti پراکنش جغرافیایی وسیعی در مناطق غربی ایران دارد. در این مطالعه الگوی قطعات حاصل از برش آنزیمی قطعه تکثیر یافته ژن16S rRNA با آنزیم Rsa I، دو گونه S. medicae و S. meliloti را به آسانی از هم تفکیک نمود که نشانگر مناسب بودن این روش برای تشخیص سریع ریزوبیومهای ایجاد کننده گره در یونجه است.
To characterize the geographical distribution of medicago-nodulating rhizobia in western regions of Iran, 950 Sinorhizobium isolates were trapped from a combination of two local alfalfa populations (Hamedani, Nikshahri) together with a foreign cultivar ( Kodi) and soil samples from eight sites across Kurdestan, Kermanshah, Eastern Azarbayjan and Lorestan provinces. Also, a total of 45 isolates were obtained from nodules of naturally grown Melilotus officinalis (14 isolates) and Trigonella foenum-graecum (31 isolates) plants in Isfahan. On the basis of PCR partial amplification of the plasmid born nod box gene and chromosomal mucR gene of the isolates,16S ribosomal DNA PCR-restriction fragment length polymorphism analysis, and the nucleotide sequence, three isolates from alfalfa, seven isolates from M. officinalis and 13 isolates from T. foenum-graecum were proved to be Sinorhizobium medicae. The remaining isolates (943 from alfalfa, seven from M. officinalis and 18 from T. foenum-graecum) were identified as S. melilloti. Both species, S. meliloti and S. medicae, were recovered from nodules of all the hosts although S. meloti was clearly more dominant in nodulating different populations of alfalfa. Taken together, these results indicated that the abundance of S. meliloti is independent of the site of isolation and have a wide geographical distribution. In this study, the banding pattern resulting from PCR amplification of 16S rRNA gene, followed by digestion with Rsa I, clearly differentiated S. meliloti and S. medica strains, showing that PCR-RFLP is an appropriate method to discriminate medicago-nodulating rhizobian with relative rapidity.
واژههای کلیدی: یونجه، شنبلیله، یونجه زرد، PCR-RFLP ، Sinorhizobium meliloti، Sinorhizobium medicae
Medicago, Melilotus, Trigonella, Sinorhizobium meliloti, Sinorhizobium medicae , PCR-RFLP.
717
726
http://jcpp.iut.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-431-2&slc_lang=fa&sid=1
M
Talebi
مجید
طالبی بداف
10031947532846009779
10031947532846009779
No
M
Bahar
مسعود
بهار
mbahar@cc.iut.ac.ir
10031947532846009995
10031947532846009995
Yes
GH
Saeedi
قدرت اله
سعیدی
10031947532846009996
10031947532846009996
No
A
Mohamadi
سید ابوالقاسم
محمدی
10031947532846009997
10031947532846009997
No